Στο Τμήμα έχει οργανωθεί εργαστήριο αγιογραφίας. στο οποίο οι φοιτητές ασκούνται στην εκμάθηση της Ζωγραφικής της Ορθόδοξης Παράδοσης.
Το μάθημα είναι οργανωμένο σε θεωρητικό και πρακτικό επίπεδο. Στο πρώτο διδάσκεται η θεωρία της Αγιογραφίας και ο τεχνικός προβληματισμός, ενημερώνονται για τις τάσεις της σύγχρονης Αγιογραφίας και κάνουν τα πρώτα μαθήματα σχεδίου. Στο δεύτερο επίπεδο, διδάσκονται την τεχνική της φορητής εικόνας και της τοιχογραφίας.
Στο εργαστήριο εκπαιδεύονται περίπου 30 φοιτητές. Στο νέο ακαδημαϊκό έτος θα προστεθεί και εργαστήριο ψηφιδωτού και ξυλογραφίας-χαρακτικής.
Το 2008 (16-18 Σεπτεμβρίου) οργανώθηκε το πρώτο διεθνές συμπόσιο Αγιογραφίας, στο οποίο συμμετείχαν ζωγράφοι από Ελλάδα, Βουλγαρία, Σερβία, Ρωσία, Ρουμανία και δόθηκε η δυνατότητα στους φοιτητές και συνέδρους να παρακολουθήσουν τις τεχνικές του κάθε Αγιογράφου.